Phewas

[GWAS data collection] GRIN에서 soy50k로 찍은 GWAS data 수집 phenotype 있는 accession들만 vcf 정리 Plink 이용하여 IBD 계산후 0.98로 cut, missing이랑 hetero 골라내기

[SNP imputation] 정순천 박사님 논문에 나온 781 accession 중 G.max만 418개 골라서 vcf 만듦 beagle 5.1 이용하여 imputation

[GEMMA] GEMMA 이용하여 MLM으로 phe:gen association보기