Difference between revisions of "Phewas"
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[GWAS data collection] GRIN에서 soy50k로 찍은 GWAS data 수집 phenotype 있는 accession들만 vcf 정리 Plink 이용하여 IBD 계산후 0.98로 cut, missing이랑 hetero 골라내기
[SNP imputation] 정순천 박사님 논문에 나온 781 accession 중 G.max만 418개 골라서 vcf 만듦 beagle 5.1 이용하여 imputation
[GEMMA] GEMMA 이용하여 MLM으로 phe:gen association보기
